А зачем они это делают?

А деньги тогда уходят в ООО?

Если учесть, что нефть это не конечный продукт то станет понятнее: из нефти вырабатывают кучу всего нужного (не только бензин). Для ее переработки нужны нпз (и они тоже есть у Роснефти).
Когда принимается решение о строительстве НПЗ берутся в учет многие факторы (в т.ч. близость к потребителю). Так же у НПЗ есть определенная мощность (как и у "скважины" для нефти).
Дак вот: если НПЗ имеет бОльшую мощность, чем тот объем нефти, которую сама компания может добыть в данном районе, то для нужд НПЗ докупают нефть. Скажем есть НПЗ в Самаре, но нефти там по каким-либо причинам не хватает (упала добыча, продали в сыром виде и т.п.). У компании есть возможно ресурс в Сибири, но гнать от туда по трубе выйдет дороже, чем купить у Лукойла (к примеру) на соседней скважине. Вот и покупают. Это вполне нормальный процесс. А если взять в расчет то, что почти все НПЗ построены во времена, когда не было разных собственников и соответственно строили их исходя из возможностей добычи и потребности в данном месте. А когда появились частные предприятия получилось, что стоит НПЗ одной компании, а нефть вокруг добывает другая компания. Надеюсь объяснил доступно.

Ходорковский говорил что его подставил Сечин и что тогда он вообще не должен был выступать перед Путиным.