Зарплата в договоре обозначается только 5к остальное премии - чем может грозить?

Налоги, отпуска и прочие ништяки - все будет по закону, раз ЗП белая.

Только в том, что премию можно дать в размере 100%, а можно в размере 20% :-).
Есть смысл почитать положение о премировании и прикинуть свои шансы на премиальную часть.

Вот еще что нашел:
Когда можно выплачивать зарплату меньше МРОТ на законных основаниях
Такое воз­мож­но, если ра­бот­ник тру­дит­ся на усло­ви­ях непол­но­го ра­бо­че­го вре­ме­ни и дан­ный факт (с ука­за­ни­ем ра­бо­чих дней и часов) за­фик­си­ро­ван в тру­до­вом до­го­во­ре или до­пол­ни­тель­ном со­гла­ше­нии к нему (ст. 93 ТК РФ). Ведь зар­пла­та вы­пла­чи­ва­ет­ся за фак­ти­че­ски от­ра­бо­тан­ное время, а если ра­бот­ник тру­дит­ся непол­ный день, то и при­чи­та­ю­ща­я­ся ему сумма может быть мень­ше МРОТ (с)